Yo sugeriría que el mejor enfoque es utilizar un editor para cambiar el bioma de todos los trozos de la zona para ser el mismo, sin cambiar los bloques en los trozos.
Esto hará que el césped del pueblo sea consistente.
Podría haber efectos secundarios, por ejemplo, ciertos mobs sólo aparecen en ciertos biomas.
Espero que esto se pueda lograr con MCEdit. Tendrías que parar el servidor, luego abrir el mundo con MCEdit, cambiar los trozos para que sean un bioma diferente, luego guardar, luego iniciar el servidor de nuevo.
Como alternativa, puede ser posible utilizar WorldEdit que es un plugin de Bukkit. En realidad no sé si permite cambiar el bioma, tendrías que investigarlo. De todos modos, te sugiero que consideres instalar WorldEdit. Es muy práctico poder copiar/pegar edificios enteros, o generar un enorme muro con unos pocos comandos.